A polipeptid peptidlánc tervezési sémája és megoldása

I. Összegzés
A peptidek speciális makromolekulák, így szekvenciáik kémiai és fizikai tulajdonságaikban szokatlanok.Egyes peptideket nehéz szintetizálni, míg mások viszonylag könnyen szintetizálhatók, de nehezen tisztíthatók.A gyakorlati probléma az, hogy a legtöbb peptid vizes oldatban gyengén oldódik, ezért tisztításunk során a hidrofób peptid megfelelő részét nem vizes oldószerben kell feloldani, ezért ezek az oldószerek vagy pufferek valószínűleg súlyosan összeegyeztethetetlenek a felhasználással. biológiai kísérleti eljárások, így a technikusoknak szigorúan tilos a peptidet saját céljaikra felhasználni, így a peptidek tervezésének több szempontja a kutatók számára.

A polipeptid peptidlánc tervezési sémája és megoldása
Másodszor, a szintetikus nehéz peptidek helyes megválasztása
1. A lefelé szabályozott sorozatok teljes hossza
A 15-nél kevesebb aminosavból álló peptidek könnyebben beszerezhetők, mivel a peptid mérete nő, és a nyerstermék tisztasága csökken.Mivel a peptidlánc teljes hossza meghaladja a 20 maradékot, a termék pontos mennyisége kulcsfontosságú.Sok kísérletben könnyen lehet váratlan hatásokat elérni, ha a szermaradékok számát 20 alá csökkentik.
2. Csökkentse a hidrofób maradékok számát
Azok a peptidek, amelyekben nagy a hidrofób csoportok túlsúlya, különösen a C-terminálistól számított 7-12 csoportban, általában szintetikus nehézségeket okoznak.Ezt éppen azért nem tartják megfelelő kombinációnak, mert a szintézis során B-hajtású lapot kapunk."Ilyen esetekben hasznos lehet kettőnél több pozitív és negatív aminosav konvertálása, vagy Gly vagy Pro hozzáadása a peptidbe a peptid összetételének feloldásához."
3. A „nehéz” szermaradékok leszabályozása
"Számos Cys-, Met-, Arg- és Try-maradék van, amelyek általában nem szintetizálódnak könnyen."A Ser-t általában a Cys nem oxidatív alternatívájaként használják.
A polipeptid peptidlánc tervezési sémája és megoldása

Harmadszor, javítsa a vízben oldódó anyagok helyes megválasztását
1. Állítsa be az N vagy C terminált
A savas peptidekhez képest (vagyis a pH 7-en negatív töltésű) az acetilezés (N-terminális acetilezés, a C-terminális mindig szabad karboxilcsoportot tart fenn) különösen ajánlott a negatív töltés növelésére.A bázikus peptidek (azaz pozitív töltésű 7-es pH-n) peptidek esetében azonban különösen ajánlott az aminálás (szabad aminocsoport az N-terminálison és aminálás a C-terminálison) a pozitív töltés növelése érdekében.

2. Jelentősen rövidítse vagy hosszabbítsa meg a sorozatot

Egyes szekvenciák nagyszámú hidrofób aminosavat tartalmaznak, például Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr és Ala stb. Ha ezek a hidrofób aminosavak 50%-ot meghaladóak, általában nem könnyen oldódnak fel.Hasznos lehet a szekvencia meghosszabbítása, hogy tovább növeljük a peptid pozitív és negatív pólusait.A második lehetőség a peptidlánc méretének leszabályozása a pozitív és negatív pólusok növelése érdekében a hidrofób aminosavak leszabályozásával.Minél erősebb a peptidlánc pozitív és negatív oldala, annál valószínűbb, hogy reakcióba lép a vízzel.
3. Tegye bele egy vízoldható maradékot
Egyes peptidláncok esetében néhány pozitív és negatív aminosav kombinációja javíthatja a vízoldékonyságot.Cégünk a savas peptidek N- vagy C-terminálisát javasolja a Glu-Glu-val kombinálni.A bázikus peptid N- vagy C-terminálisát, majd a Lys-Lys-t adtuk meg.Ha a töltött csoport nem helyezhető el, a Ser-Gly-Ser az N vagy C végpontba is elhelyezhető.Ez a megközelítés azonban nem működik, ha a peptidlánc oldalait nem lehet megváltoztatni.